| 桃小食心虫鱼尼丁受体基因克隆及表达模式分析 |
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| 引用本文： | 孙丽娜,张怀江,闫文涛,马春森,仇贵生.桃小食心虫鱼尼丁受体基因克隆及表达模式分析[J].中国农业科学,2015,48(10):1971-1981. |
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| 作者姓名： | 孙丽娜 张怀江 闫文涛 马春森 仇贵生 |
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| 基金项目： | 中央级基本科研业务费预算增量项目（2014ZL014）、植物病虫害生物学国家重点实验室开放基金课题（SKLOF201309）、辽宁省博士启动基金（20141157） |
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| 摘 要： | 【目的】二酰胺类杀虫剂的作用靶标鱼尼丁受体(ryanodine receptor,Ry R)是目前所知的最大的离子通道蛋白,该受体可控制细胞内Ca2+的释放,对细胞内Ca2+的稳定起着关键作用。克隆获得桃小食心虫鱼尼丁受体基因(Cs Ry R)全长序列,进一步解析该基因在桃小食心虫(Carposina sasakii)各发育阶段的表达模式。【方法】通过同源序列比对的方法,利用c DNA末端快速扩增技术(RACE)获得该基因的全长c DNA序列;应用生物信息学软件对该基因的开放阅读框、编码的氨基酸序列、功能结构域等信息进行预测分析,并基于最大似然法构建该基因与其他昆虫相关基因序列的系统发育树,明确其系统进化关系。分别提取桃小食心虫各发育阶段RNA,以GAPDH为内参基因,应用RT-q PCR技术,解析Cs Ry R在桃小食心虫各发育阶段(卵、幼虫、蛹和成虫)的表达模式。【结果】桃小食心虫Cs Ry R的c DNA全序列长度为15 766 bp,开放阅读框15 405 bp,编码5 134个氨基酸。氨基酸序列比对结果显示,Cs Ry R与脊椎动物Ry Rs的一致度分别为45%—47%;与秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)Ry R的一致度也为46%。在昆虫Ry Rs中,与鳞翅目一致度为91%—94%,与同翅目、双翅目昆虫一致度均为79%。系统发育树显示该基因编码的蛋白质与鳞翅目夜蛾科和螟蛾科害虫Ry Rs亲缘关系最近。结构域分析结果显示,Cs Ry R具有Ry R的典型结构域,如位于C-末端的6个跨膜结构域(AA 4 467-5 029)、释放Ca2+的通道形成基序GVRAGGGIGD、Ca2+结合位点EF-hand和3个ATP结合位点GXGXXG等。二酰胺类杀虫剂可能的作用位点AA 183-290(Bm Ry R),AA 4 610-4 655(Dm Ry R)和4 946G(Px Ry R)在Cs Ry R中无特殊性。此外,Cs Ry R中存在AA 2 490-2 496 TQAPRPG和5 131-5 134 SQAK两个基序,在其他物种中均没有发现。RT-q PCR分析结果表明,Cs Ry R在蛹期表达量最高,分别是1日龄卵、6日龄卵、初孵幼虫、老熟幼虫和成虫的25.19、7.73、6.48、4.74和3.58倍。【结论】克隆了Cs Ry R基因全长c DNA序列,证明其表达具有发育阶段特异性。
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| 关 键 词： | 桃小食心虫 鱼尼丁受体 基因克隆 发育阶段 表达模式 |
| 收稿时间： | 2014-12-04 |
Molecular Cloning and Expression Profiling of a Ryanodine Receptor Gene in the Peach Fruit Moth (Carposina sasakii) |
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| SUN Li-na,ZHANG Huai-jiang,YAN Wen-tao,MA Chun-sen,QIU Gui-sheng.Molecular Cloning and Expression Profiling of a Ryanodine Receptor Gene in the Peach Fruit Moth (Carposina sasakii)[J].Scientia Agricultura Sinica,2015,48(10):1971-1981. |
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| Authors: | SUN Li-na ZHANG Huai-jiang YAN Wen-tao MA Chun-sen QIU Gui-sheng |
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| Affiliation: | 1.Research Institute of Pomology, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Xingcheng 125100, Liaoning;2.State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases and Insect Pests, Institute of Plant Protection, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Carposina sasakii ryanodine receptor gene clone developmental stage expression profiling |
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