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克氏原螯虾抗菌肽crustin5基因克隆及其表达分析
引用本文:李博,王凯,于晓东,刘睿哲,蔺思函,商静,沈秀丽,杜志强.克氏原螯虾抗菌肽crustin5基因克隆及其表达分析[J].南方农业学报,2020,51(4):953-960.
作者姓名:李博  王凯  于晓东  刘睿哲  蔺思函  商静  沈秀丽  杜志强
作者单位:内蒙古科技大学生命科学与技术学院,内蒙古包头,014010内蒙古科技大学图书馆,内蒙古包头,014010
摘    要:目的]深入了解克氏原螯虾先天免疫过程中抗菌肽的作用与功能,丰富先天免疫中抗菌肽的理论知识,为克氏原螯虾的病害机理研究及防控措施制定提供参考依据.方法]从克氏原螯虾肝胰腺组织提取总RNA,利用PCR扩增crustin5基因全长cDNA序列,运用DNAMAN 6.0、ProtParam、ProtScale、SOPMA和SWISS-MODEL等在线软件对其进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测crustin5基因在克氏原螯虾各组织中的表达情况.结果]克氏原螯虾crustin5基因cDNA序列全长954 bp,开放阅读框(ORF)为429 bp,共编码167个氨基酸残基,其编码蛋白相对分子量为16485.42 Da,理论等电点为8.58,为不稳定的疏水性蛋白.克氏原螯虾crustin5蛋白具有典型的crustins家族结构特征,包括N端的信号肽,C端的WAP结构域,以及二者间的半胱氨酸富集区;其二级结构中α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸链分别占20.36%、7.78%、58.08%和13.77%.crustin5基因在克氏原螯虾血细胞、肝胰腺、鳃、肠道、肌肉和淋巴器官等6种组织中均有不同程度的表达,以在血细胞中的相对表达量最高,淋巴器官次之,在肌肉组织中的相对表达量最少.结论]克氏原螯虾抗菌肽crustin5具有典型的crustins家族结构特征,且主要分布在血细胞和淋巴器官中,说明crustin5是在克氏原螯虾的血淋巴中参与先天免疫并发挥抗菌作用.

关 键 词:克氏原螯虾    抗菌肽    crustin5基因    先天免疫    表达差异

Gene cloning and expression analysis of crustin5 gene in Procambarus clarkii
LI Bo,WANG Kai,YU Xiao-dong,LIU Rui-zhe,LIN Si-han,SHANG Jing,SHEN Xiu-li,DU Zhi-qiang.Gene cloning and expression analysis of crustin5 gene in Procambarus clarkii[J].Journal of Southern Agriculture,2020,51(4):953-960.
Authors:LI Bo  WANG Kai  YU Xiao-dong  LIU Rui-zhe  LIN Si-han  SHANG Jing  SHEN Xiu-li  DU Zhi-qiang
Abstract:
Keywords:
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