| 湖北和广西辣椒脉斑驳病毒的检测及
遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 李桑桑,胡荣,罗香文,李诗君,卜珊,张宇,刘勇,张松柏.湖北和广西辣椒脉斑驳病毒的检测及
遗传多样性分析[J].南方农业学报,2020,51(7):1693-1698. |
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| 作者姓名： | 李桑桑 胡荣 罗香文 李诗君 卜珊 张宇 刘勇 张松柏 |
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| 作者单位： | 湖南大学研究生院隆平分院,长沙 410125湖南省农业科学院植物保护研究所,长沙 41025 |
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| 摘 要： | 目的]研究辣椒脉斑驳病毒(Pepper veinal mottle virus,PVMV)的分布及遗传变异,为明确该病毒在我国的流行扩散分子机制提供理论依据.方法]利用特异性引物反转录PCR(RT-PCR)检测从湖北宜昌及广西南宁和百色采集的48份疑似感染PVMV的辣椒样本;采用常规Sanger测序测定PCR产物序列,序列采用MEGA 5.0构建系统发育进化树,采用RDP等算法分析其可能的重组事件;采用DnaSP v5分析病毒株系不同群体之间的基因流及基因差异.结果]从48份辣椒样本中检测到5份样本被PVMV侵染,检出率10.42%.基因同源性比对分析结果表明,测定的PVMV湖北和广西分离物CP基因序列同源性在97.00%以上,与其他地区分离物的同源性为91.73%~98.78%.系统发育分析表明,湖北(YC)和广西(NN)PVMV分离物与我国台湾PVMV分离物的亲缘关系最近.重组分析表明,PVMV广西分离物NN10有2个重组事件.结论]湖北和广西辣椒的PVMV检测结果表明,该病毒已扩散至湖北和广西;基因突变可能是PVMV湖北分离物遗传变异的主要方式之一;而基因重组和基因突变可能是PVMV广西分离物遗传变异的重要因子.
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| 关 键 词： | 辣椒脉斑驳病毒 RT-PCR 系统发育分析 重组 湖北 广西 |
Detection and genetic identity of Pepper veinal mottle virus in Hubei and Guangxi |
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| LI Sang-sang,HU Rong,LUO Xiang-wen,LI Shi-jun,BU Shan,ZHANG Yu,LIU Yong,ZHANG Song-bai.Detection and genetic identity of Pepper veinal mottle virus in Hubei and Guangxi[J].Journal of Southern Agriculture,2020,51(7):1693-1698. |
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| Authors: | LI Sang-sang HU Rong LUO Xiang-wen LI Shi-jun BU Shan ZHANG Yu LIU Yong ZHANG Song-bai |
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