| 光皮桦AP2/ERF基因家族鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 黄奕孜,钱旺,邱姗,王文新,黄华宏,林二培.光皮桦AP2/ERF基因家族鉴定与表达分析[J].浙江农林大学学报,2022,39(6):1183-1193. |
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| 作者姓名： | 黄奕孜 钱旺 邱姗 王文新 黄华宏 林二培 |
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| 作者单位： | 浙江农林大学 省部共建亚热带森林培育国家重点实验室，浙江 杭州 311300 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(31770641)；浙江省重点研发计划项目(2021C02037) |
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| 摘 要： | 目的 深入研究AP2/ERF基因家族在光皮桦Betula luminifera生长发育及环境胁迫响应中的生物学功能。 方法 利用光皮桦基因组数据，通过生物信息学方法开展AP2/ERF基因家族鉴定、基因特征、系统进化、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白互作和表达分析。 结果 在光皮桦基因组中共鉴定到77个AP2/ERF基因，其编码的蛋白理化性质存在差异，大多数蛋白(60个)的理论等电点小于7.0。系统进化分析显示:这77个AP2/ERF转录因子属于5个亚家族，其中ERF亚家族最大，包含34个成员。光皮桦AP2/ERF各亚家族间的基因结构存在较大差异，其中AP2亚家族成员均具有6~9个内含子，而DREB亚家族基因则没有内含子；但AP2/ERF各亚家族内的不同成员具有相似的保守基序类型和分布。同时，AP2/ERF基因启动子上都存在大量与激素、调节、胁迫响应及生长发育相关的顺式作用元件。此外，互作网络分析预测不同的光皮桦AP2/ERF亚家族蛋白间存在广泛的互作关系。进一步的表达分析显示:绝大多数光皮桦AP2/ERF基因(71个)的表达存在较强组织特异性，且在高温胁迫下，多数ERF或DREB基因的表达发生显著变化，表明ERF和DREB基因在高温胁迫应答中可能发挥着重要作用。 结论 通过生物信息学分析获得光皮桦77个AP2/ERF基因，分属于5个亚家族。不同亚家族基因具有相似的基因结构、保守基序等特征。基因启动子区含激素、胁迫响应等相关的作用元件。基因表达具有较强的组织特异性，且多数ERF或DREB基因对高温胁迫有明显响应。图6表1参39
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| 关 键 词： | 光皮桦 AP2/ERF家族 表达模式 高温胁迫 |
| 收稿时间： | 2022-04-29 |
Identification and expression analysis of AP2/ERF gene family in Betula luminifera |
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| HUANG Yizi,QIAN Wang,QIU Shan,WANG Wenxin,HUANG Huahong,LIN Erpei.Identification and expression analysis of AP2/ERF gene family in Betula luminifera[J].Journal of Zhejiang A&F University,2022,39(6):1183-1193. |
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| Authors: | HUANG Yizi QIAN Wang QIU Shan WANG Wenxin HUANG Huahong LIN Erpei |
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| Affiliation: | State Key Laboratory of Subtropical Silviculture, Zhejiang A&F University, Hangzhou 311300, Zhejiang, China |
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| Keywords: | |
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