玉米大斑病菌醇脱氢酶基因家族的鉴定和生物信息学分析 |
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引用本文: | 张淑红,张运峰,武秋颖,高凤菊,李亚子,纪景欣,许可,范永山.玉米大斑病菌醇脱氢酶基因家族的鉴定和生物信息学分析[J].浙江农业学报,2023(5):1108-1115. |
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作者姓名: | 张淑红 张运峰 武秋颖 高凤菊 李亚子 纪景欣 许可 范永山 |
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作者单位: | 唐山师范学院生命科学系唐山市农业病原真菌与毒素重点实验室 |
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基金项目: | 唐山师范学院科研项目(2021B30,2021B34); |
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摘 要: | 醇脱氢酶(alcohol dehydrogenase, ADH)是生物体内主要短链醇代谢的关键酶,在物质代谢和能量转化过程中发挥着重要作用。本文从玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)基因组的KEGG数据库中获得了22个ADH基因家族成员(StADH1-StADH22),它们散布在12条scaffold上,长232~495 aa,理论等电点5.65~9.22,81.8%家族成员呈酸性,72.7%为亲水蛋白,有4个家族成员定位于线粒体,2个定位于过氧化物酶体,其余16个家族成员均定位于细胞质。系统发育分析结果表明,有11个玉米大斑病菌ADH家族蛋白与酵母ADH(YADH1-7)亲缘关系较近,含有相似的保守基序和结构域,其他11个玉米大斑病菌ADH家族蛋白与酵母ADH亲缘关系较远,含有不同的保守基序和结构域。玉米大斑病菌侵染玉米叶片的转录组分析结果表明,仅有4个ADH基因(StADH1、StADH4、StADH6和StADH12)参与病菌侵染过程,其中StADH1、StADH4和StADH12主要在病菌侵染后期发挥作用,而StADH1还可能与病菌的致病专化性有关。
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关 键 词: | 玉米大斑病菌 醇脱氢酶(ADH) 基因家族 转录组 致病性 |
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