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Biolog法测定土壤微生物群落功能多样性预处理方法的筛选
引用本文:党 雯,郜春花,张 强,李建华,卢朝东,靳东升,卢晋晶.Biolog法测定土壤微生物群落功能多样性预处理方法的筛选[J].中国农学通报,2015,31(2):153-158.
作者姓名:党 雯  郜春花  张 强  李建华  卢朝东  靳东升  卢晋晶
作者单位:新疆维吾尔自治区药物研究所/新疆维吾尔药重点实验室,新疆维吾尔自治区药物研究所/新疆维吾尔药重点实验室,新疆维吾尔自治区药物研究所/新疆维吾尔药重点实验室,新疆维吾尔自治区药物研究所/新疆维吾尔药重点实验室
基金项目:基金项目:新疆维吾尔自治区优秀青年科技创新人才培养项目“基于DNA条形码技术的盒果藤等五种维吾尔药材正伪品鉴定研究”(2013721034)。
摘    要:作为测定微生物群落功能多样性主要方法之一的biolog法,由于操作简单、灵敏度高、分辨力强、获得数据量丰富,受到众多研究者的青睐,但文献中报道的有关实验预处理方法却不尽相同。为了筛选最佳的预处理方法,通过比较文献中3种较为常用的方法,研究不同预处理对biolog法测定微生物群落功能多样性的影响。结果表明:AWCD值总体变化趋势B方法优于A、C;微生物对六类碳源的利用率中B方法对大部分碳源利用较高,且结果较稳定;两种处理的Simpson指数、Shannon丰富度指数及碳源利用丰富度指数均BCA,而Mc Intosh指数、Shannon均匀度结果不太稳定,但经方差分析,其差异不显著,且B方法的方差最小;主成分分析的结果 B方法优于A与C。总之,在250 r/min的转速下震荡30 min,并于28℃条件下培养接种平板的处理(B法)效果较好,其测定结果重现性好,且操作简便快捷,是比较理想的预处理方法。

关 键 词:Biolog法  预处理方法  土壤微生物群落  功能多样性  AWCD值
收稿时间:2014/8/12 0:00:00
修稿时间:2015/1/22 0:00:00

Screening of Preprocessing Methods of Biolog for Soil Microbial Community Functional Diversity
Dang Wen,Gao Chunhu,Zhang Qiang,Li Jianhu,Lu Chaodong,Jin Dongsheng and Lu Jinjing.Screening of Preprocessing Methods of Biolog for Soil Microbial Community Functional Diversity[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2015,31(2):153-158.
Authors:Dang Wen  Gao Chunhu  Zhang Qiang  Li Jianhu  Lu Chaodong  Jin Dongsheng and Lu Jinjing
Affiliation:Key Laboratory of Xinjiang Uighur Medicine, Xinjiang Institute of Materia Medica,Key Laboratory of Xinjiang Uighur Medicine, Xinjiang Institute of Materia Medica,Key Laboratory of Xinjiang Uighur Medicine, Xinjiang Institute of Materia Medica,Key Laboratory of Xinjiang Uighur Medicine, Xinjiang Institute of Materia Medica
Abstract:
Keywords:plant isoprenoid biosynthesis  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate (DXS)  sequence analysis  bioinformatics
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