| 意大利蜜蜂Hippo信号通路相关基因及其全长转录本的鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 张佳欣,高旭泽,陈梦君,宋宇轩,荆欣,刘治滩,冯佩林,陈大福,郭睿.意大利蜜蜂Hippo信号通路相关基因及其全长转录本的鉴定与分析[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2023,49(5). |
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| 作者姓名： | 张佳欣 高旭泽 陈梦君 宋宇轩 荆欣 刘治滩 冯佩林 陈大福 郭睿 |
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| 作者单位： | 1.福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)，福建 福州 350002；2.福建省蜂疗研究所，福建 福州 350002 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目(32172792)；国家现代农业产业技术体系专项资金项目(CARS–44–KXJ7)；福建省自然科学基金面上项目(2022J01131334)；福建农林大学科技创新专项基金项目(KFb22060XA) |
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| 摘 要： | 采用Blast工具将已鉴定到的意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica，简称意蜂)全长转录本比对Nr数据库，共鉴定到意蜂Hippo信号通路中相关的49个基因及其550条全长转录本。运用Gffcompare软件将鉴定到的Hippo信号通路相关全长转录本与西方蜜蜂参考基因组(Amel_HAv3.1)上注释的转录本进行比较，分别延长西方蜜蜂参考基因组注释到Hippo信号通路的9个基因的5'' UTR和7个基因的3'' UTR。通过Astalavista软件鉴定到Hippo信号通路相关的4个基因的7次可变剪切(AS)事件，包括2次外显子跳跃、2次内含子保留和3次可变5''端剪接。通过PCR验证了1个基因的AS事件真实性。利用TAPIS pipeline鉴定到意蜂Hippo信号通路相关的24个基因含有1个及以上可变多聚腺苷酸化(APA)位点，其中含有1个APA位点的基因数量最多。通过TBtool软件鉴定APA位点上游motif的一致性序列HVNCCNBNDYVDVVHVNDBVDYCNBBDNNNHNNVNNVMNN。
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| 关 键 词： | 西方蜜蜂 意大利蜜蜂 Hippo信号通路相关基因 全长转录本 |
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