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芹菜APX基因家族鉴定及其表达分析
引用本文:杜佳庚,周瑾,李晓燕,张颖,伍丽梅,李梦瑶.芹菜APX基因家族鉴定及其表达分析[J].干旱地区农业研究,2023(6):54-63.
作者姓名:杜佳庚  周瑾  李晓燕  张颖  伍丽梅  李梦瑶
作者单位:四川农业大学园艺学院,四川 成都 611130
基金项目:国家自然科学基金项目(32002027);四川省自然科学基金项目(2022NSFSC1674)
摘    要:抗坏血酸过氧化物酶(Ascorbate peroxidase, APX)是植物活性氧代谢中重要的抗氧化酶之一,在植物抵抗氧化胁迫方面发挥重要作用。利用生物信息学方法对芹菜基因组中的APX基因家族成员进行鉴定和分析,并通过实时荧光定量PCR(quantitative real\|time PCR, qRT-PCR)验证分析AgAPXs在高温胁迫下的表达情况,为开展芹菜APX基因参与高温胁迫调控机制提供依据。结果表明:芹菜基因组中共有9个APX基因,随机分布在5个染色体上,并出现了基因片段复制现象;大多数基因被定位在细胞质中。系统发育分析表明,AgAPX基因家族可分为3个亚族,同一亚族中的成员具有相似的基因结构和基序。启动子顺式元件分析表明,大多数AgAPX基因含有多种与生长发育、植物激素和逆境胁迫相关的顺式元件。高温胁迫下,芹菜APX活性提高。qRT-PCR分析表明,AgAPXs在不同时间的高温处理下表达具有显著差异,并与转录组表达丰度相一致,AgAPX2AgAPX3AgAPX4AgAPX5AgAPX7的表达量和APX活性具有显著相关性,推测AgAPXs可能参与了芹菜抵御高温的调控过程。本研究初步鉴定并提供了芹菜APX基因家族成员信息,为今后进一步探索芹菜APX基因功能提供了重要的研究基础。

关 键 词:芹菜  APX  系统进化  顺式元件  高温胁迫应答

Identification and expression analysis of APX gene family in celery (Apium graveolens L.)
DU Jiageng,ZHOU Jin,LI Xiaoyan,ZHANG Ying,WU Limei,LI Mengyao.Identification and expression analysis of APX gene family in celery (Apium graveolens L.)[J].Agricultural Research in the Arid Areas,2023(6):54-63.
Authors:DU Jiageng  ZHOU Jin  LI Xiaoyan  ZHANG Ying  WU Limei  LI Mengyao
Abstract:
Keywords:Apium graveolens L    APX  system evolution  cis\|element  high temperature response
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