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基于4D label-free技术的水稻成熟种子蛋白质组学研究
引用本文:梁文轩,王月萍,陈升杰,李敏诗,韩儒,周玉亮.基于4D label-free技术的水稻成熟种子蛋白质组学研究[J].华南农业大学学报,2023,44(5):742-749.
作者姓名:梁文轩  王月萍  陈升杰  李敏诗  韩儒  周玉亮
作者单位:广东省植物分子育种重点实验室/华南农业大学 农学院, 广东 广州 510642
基金项目:国家自然科学基金面上项目(31771888);“双一流”学科建设和提升专项(2021B10564001);广东省自然科学基金面上项目(2022A1515010843)。
摘    要:【目的】从蛋白水平揭示水稻种子成熟的分子基础,探究调控水稻种子成熟的关键蛋白和代谢通路。【方法】选用授粉后30 d的成熟水稻种子,利用4D label-free定量蛋白质组学进行质谱鉴定,通过生物信息学技术分析蛋白的亚细胞定位、结构域、GO注释和KEGG通路注释。【结果】总共鉴定了3 484个种子成熟期的蛋白,相对分子质量大多在10 000~100 000之间,主要分布于细胞质、细胞核、叶绿体、线粒体和质膜上;结构域主要涉及蛋白质翻译的RNA识别基序和蛋白磷酸化修饰的蛋白激酶结构域;GO分析表明,成熟种子的蛋白主要参与了细胞过程和代谢过程,主要涉及催化活性和结合等功能,大多分布在细胞、细胞组分、细胞器和细胞膜等部位;KEGG分析发现,蛋白主要富集在核糖体、内质网中的蛋白质加工、氧化磷酸化和糖酵解等途径,推测蛋白质的翻译、加工和能量代谢是水稻种子成熟期的主要分子事件;进一步鉴定了脱落酸(Abscisic acid,ABA)信号和吲哚乙酸(Indoleacetic acid,IAA)代谢的相关蛋白,同时也发现了NAC(NAM、ATAF1/2和CUC2)家族的转录因子。【结论】贮藏物质的积累...

关 键 词:水稻  种子成熟  代谢通路  植物激素
收稿时间:2023/7/30 0:00:00

Proteomics study of mature rice seeds based on 4D label-free technology
LIANG Wenxuan,WANG Yueping,CHEN Shengjie,LI Minshi,HAN Ru,ZHOU Yuliang.Proteomics study of mature rice seeds based on 4D label-free technology[J].Journal of South China Agricultural University,2023,44(5):742-749.
Authors:LIANG Wenxuan  WANG Yueping  CHEN Shengjie  LI Minshi  HAN Ru  ZHOU Yuliang
Affiliation:Guangdong Provincial Key Laboratory of Plant Molecular Breeding/College of Agriculture, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China
Abstract:
Keywords:Rice  Seed maturation  Metabolic pathway  Plant hormone
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