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青稞酸性磷酸酶基因HvnACP2克隆和亚细胞定位研究
引用本文:安立昆,任晴雯,姚晓华,姚有华,吴昆仑.青稞酸性磷酸酶基因HvnACP2克隆和亚细胞定位研究[J].西北农业学报,2023(10):1534-1543.
作者姓名:安立昆  任晴雯  姚晓华  姚有华  吴昆仑
作者单位:(1.青海大学 农林科学院,西宁 810016;2.青海省青稞遗传育种重点实验室,西宁 810016;3.国家麦类改良中心青海青稞分中心,西宁 810016)
基金项目:青海省自然科学青年基金(2020-ZJ-973Q)。
摘    要:为了探索青稞酸性磷酸酶基因 HvnACP2的基因和蛋白结构特点,为青稞磷吸收利用机制研究提供基础。以青稞‘肚里黄’叶片为材料,根据植物基因组数据库Gramene中的大麦 HvACP2基因和启动子区域序列设计引物,通过PCR获得青稞 HvnACP2基因和启动子区域序列。采用生物信息学软件对 HvnACP2基因启动子区域元件以及蛋白理化性质、跨膜结构、磷酸化位点、信号肽、二级、三级结构进行分析。结果表明: HvnACP2有2个外显子和1个内含子,启动子区域有与分生组织、光响应、厌氧、茉莉酸和脱落酸相关的顺式作用元件。HvnACP2蛋白由454个氨基酸组成,分子质量为51 285.15 u,总原子数为7 058,亲水系数为-0.451,理论等电点为6.17,不稳定指数34.54,脂溶性指数为67.05。具有12个磷酸化位点和信号肽,不具有跨膜结构。 HvnACP2中α螺旋、延长链、β转角、无规则卷曲所占比例分别为18.72%、53.96%、23.57%、3.74%。 HvnACP2和其他物种的同源蛋白都有紫色酸性磷酸酶N末端结构域和金属酸性磷酸酶结构域,将 HvnACP2与其他植物的氨基酸序...

关 键 词:青稞  酸性磷酸酶  HvnACP2基因  生物信息学分析

Cloning and Subcellular Localization of Acid Phosphatase-encoding Gene HvnACP2 in Hulless Barley
AN Likun,REN Qingwen,YAO Xiaohu,YAO Youhua and WU Kunlun.Cloning and Subcellular Localization of Acid Phosphatase-encoding Gene HvnACP2 in Hulless Barley[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2023(10):1534-1543.
Authors:AN Likun  REN Qingwen  YAO Xiaohu  YAO Youhua and WU Kunlun
Abstract:
Keywords:Hulless barely(Hordeum vulgare L  var  nudum Hook  f  )  Acid phosphatase    HvnACP2 gene  Bioinformatics analysis
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