| 广西不同地区克氏原螯虾群体遗传多样性微卫星分析 |
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| 引用本文： | 黄小芳,唐章生,刘俊丹,张宏燕,钟一治,卢智发,侯树鉴,王大鹏,陆专灵.广西不同地区克氏原螯虾群体遗传多样性微卫星分析[J].南方农业学报,2020,51(2):437-444. |
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| 作者姓名： | 黄小芳 唐章生 刘俊丹 张宏燕 钟一治 卢智发 侯树鉴 王大鹏 陆专灵 |
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| 作者单位： | 广西水产科学研究院/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,南宁 530021广西大学动物科学技术学院/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530004广西水产科学研究院/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,南宁,530021广西大学动物科学技术学院/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁,530004广西南宁研乐上生物技术有限公司,南宁 530004 |
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| 摘 要： | 目的]了解当前广西克氏原螯虾(Procambarus clarkii)群体的遗传背景,为其人工养殖及种质资源保护提供参考依据.方法]选取广西5个地区(南宁、大塘、融水、柳州和来宾)的克氏原螯虾群体作为研究对象,利用8对微卫星引物对各克氏原螯虾群体基因组DNA进行PCR检测,然后通过PopGene32和NTSYSpc 2.1等在线软件分析广西克氏原螯虾群体的遗传多样性.结果]南宁(NN)、大塘(DT)、融水(RS)、柳州(LZ)和来宾(LB)5个克氏原螯虾群体的平均有效等位基因数(Ne)为2.5142~3.0574,平均期望杂合度(He)为0.5708~0.6489,平均多态信息含量(PIC)为0.4899~0.5843,存在中度至高度的遗传多样性,其中南宁群体和大塘群体的遗传多样性略低于融水群体、柳州群体和来宾群体.5个克氏原螯虾群体的平衡偏离指数(D)均为负值,且发生一定程度的Hardy-Weinberg平衡偏离,杂合子缺失现象普遍存在.5个克氏原螯虾群体间的基因流(Nm)为2.3898~6.0284,遗传分化指数(Fst)为0.0398~0.0947,表明各群体间存在广泛的基因交流,仅存在低度至中度的遗传分化;各克氏原螯虾群体间的遗传相似系数和遗传距离分别为0.6861~0.8583和0.1528~0.3768,其中,遗传距离趋势与Fst趋势一致,而遗传相似系数与Nm趋势一致,均表明柳州群体与来宾群体具有高度的相似性,遗传距离较近.UPGMA聚类分析结果也显示,南宁群体和大塘群体聚类为一支,而柳州群体先与来宾群体聚类再与融水群体聚类成另一支.结论]广西不同地区克氏原螯虾群体具有一定的遗传多样性,但其杂合子缺失现象普遍存在,应通过适当引种及加强不同地区群体间的遗传交流,保护好克氏原螯虾的优良种质资源.
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| 关 键 词： | 克氏原螯虾 遗传多样性 微卫星位点 杂合子缺失 广西 |
Genetic diversity microsatellite analysis of Procambarus clarkii populations in different regions of Guangxi |
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| HUANG Xiao-fang,TANG Zhang-sheng,LIU Jun-dan,ZHANG Hong-yan,ZHONG Yi-zhi,LU Zhi-fa,HOU Shu-jian,WANG Da-peng,LU Zhuan-ling.Genetic diversity microsatellite analysis of Procambarus clarkii populations in different regions of Guangxi[J].Journal of Southern Agriculture,2020,51(2):437-444. |
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| Authors: | HUANG Xiao-fang TANG Zhang-sheng LIU Jun-dan ZHANG Hong-yan ZHONG Yi-zhi LU Zhi-fa HOU Shu-jian WANG Da-peng LU Zhuan-ling |
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